2016年到2017赛季的欧洲冠军联赛（欧冠）中，巴塞罗那在小组赛中被淘汰，这场比赛的失利让梅西感到非常遗憾，他在赛后表示：“这是一个非常艰难的比赛，我在场上没有发挥好。”同时他也表示：“我知道我们应该赢得比赛，但是我们并没有达到这个水平。”而在8强淘汰赛中，巴塞罗那与尤文图斯进行了激烈的对决，在比赛中，梅西虽然在关键时刻站出来帮助球队扳平比分，但他在终场前因为一次技术失误被红牌罚下，这使得他的球队在次回合失去了球员，尽管如此，巴塞罗那还是凭借自己出色的防守和稳定的进攻，最终在16-17的半决赛中击败了尤文图斯，晋级到了决赛，在决赛中，他们遇到了皇家马德里的队伍，经过一场激烈的比赛，最终皇家马德里以4：1的比分战胜了巴塞罗那，捧起了冠军奖杯，这是巴塞罗那自2009年以来再次获得欧冠冠军。
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